吴茱萸味辛、苦，性热，归肝、脾、胃经。有散寒止痛、疏肝理气、助阳止泻、温脾燥湿的功效。可治疗寒凝气滞、肝郁胸闷、胁痛口苦、呕吐吞酸、脾肾阳虚、五更泄泻、高血压、皮肤病。
1.散寒止痛
吴茱萸辛散苦泻，性热祛寒，主入肝经，可散肝经治寒邪，是治疗肝寒气滞所引发疼痛的主要药物，具有散寒止痛的功效，可用于寒凝气滞、脘腹冷痛、厥阴头痛、疝痛、脚气肿痛等症。
现代医学研究发现，吴茱萸中含有吴茱萸碱、吴茱萸次碱、异吴茱萸碱及吴茱萸内酯，可作用于中枢神经系统，达到镇痛的作用。
2.疏肝理气
吴茱萸还可疏肝气之郁滞，可疏肝下气、降逆止呕，可用于脘腹胀痛、肝郁化火、肝胃不和、胁痛口苦、呕吐吞酸等症。
3.助阳止泻
吴茱萸性味辛热，能温脾燥湿、助阳益肾、止泻，是治疗脾肾阳虚、五更泄泻的常用药。
4. 保护血管
吴茱萸能抑制血小板聚集，抑制血小板血栓及纤维蛋白血栓的形成，可保护血管，防治动脉硬化。吴茱萸水煎剂具有降低血压的作用，可用于治疗高血压疾病。
5.抗菌消炎
吴茱萸煎剂对霍乱弧菌有较强的抑制作用。对堇色毛癣菌、 同心性毛癣菌、许兰黄癣菌、奥杜盎小芽胞癣菌、铁锈色小芽孢癣菌、羊毛状小芽孢癣菌、石膏样小芽孢癣菌、腹股沟表皮癣菌、星形奴卡菌等皮肤真菌均有不同程度的抑制作用，可用于治疗真菌引起的皮肤病。
