花椒用作中药，有温中行气、抑菌、驱虫、降血压等功效。治胃腹冷痛、呕吐、泄泻、血吸虫、蛔虫等症。又作表皮麻醉剂。
1、增加食欲
花椒气味芳香，可除各种肉类的腥膻臭气，能促进唾液分泌，增加食欲。
2、抗菌
花椒中含有很多挥发性植物油，尤其是其中的柠檬烯物质具有较强的杀菌抗菌作用，花椒泡水后可用来清洗伤口，对白喉杆菌、炭疽杆菌、肺炎双球菌以及一些皮肤真菌都有很强的抑制作用，用花椒煮水漱口对牙周炎、口腔溃疡等有很好的治疗效果。
3、散寒
花椒性温热，食用能增高体内热气，除了调味食用外，中医常用来配以干姜和饴糖等同用，有很好的温中散寒功效，适合心腹冷痛，中焦虚寒而腹痛的人群食用。
4、治疗外阴瘙痒
花椒具有麻醉、杀菌、消炎等功效，在民间妇女们常用花椒煮水清洗外阴，能起到很好的杀菌作用，对外阴瘙痒或菌类感染效果很好。
5、防牙痛
如果是冷热食物引起的牙痛，用一粒花椒放在患痛的牙上，痛感就会慢慢消失。
6、降血压
有研究发现，花椒能使血管扩张，从而能起到降低血压的作用。
营养价值
花椒果皮含有挥发油，油的主要成分为柠檬烯、枯醇、牛儿醇。此外并含有植物甾醇及不饱和有机酸等多种化合物。
1、本品挥发油对11种皮肤癣菌和4种深部真菌均有一定的抑制和杀灭作用，其中羊毛样小孢子菌和红色毛癣菌最敏感，MIC低于0.1HL／ml，MFC为0.1HL／ml。
2、花椒水提物10～20g／kg和花椒醚提物0.3ml／kg剂量下对大鼠血栓形成有明显抑制作用,此外也有预防血栓形成的作用。
3、花椒所含的茵芋碱有麻黄碱样作用，但强度较弱，可升高麻醉猫血压，增强瞬膜收缩，抑制小肠收缩及扩张冠状血管，提高横纹肌张力，加强脊髓反射兴奋性。有较强的抗菌作用。
4、花椒所含挥发油在保温的任氏液中能使猪蛔虫严重中毒。
